Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PNMA2Q9UL42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA2Q9UL42 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA2Q9UL42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms