Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMFRQ9UKV5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms