Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3Q9UKS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms