Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM4Q9UKN5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM4Q9UKN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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