Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VPREB3Q9UKI3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms