Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF221Q9UK13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF221Q9UK13 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF221Q9UK13 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms