Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH22Q9UJ99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH22Q9UJ99 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms