Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGEF1Q9UJ41 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGEF1Q9UJ41 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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