Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP2Q9UHC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms