Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS7AQ9UBW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS7AQ9UBW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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