Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3KQ9UBQ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3KQ9UBQ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms