Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms