Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD3Q9NY59 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMPD3Q9NY59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD3Q9NY59 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms