Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT4Q9NX09 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT4Q9NX09 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT4Q9NX09 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms