Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN6Q9NWW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms