Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 FAM182B-208ENST00000584071 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.31■□□□□ 0.045e-6■■■■□ 26.4
SLTMQ9NWH9 FAM182B-209ENST00000584356 610 ntTSL 49.71□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 26.4
SLTMQ9NWH9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.966e-6■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.45□□□□□ -0.94e-14■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.014e-14■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 39.7□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 TBCD-211ENST00000572984 682 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 26.3
SLTMQ9NWH9 LRRC37A3-207ENST00000580439 513 ntTSL 316.52■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 217.43■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 228.63■■■□□ 2.172e-7■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 320.43■□□□□ 0.862e-7■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 315.21■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-206ENST00000474429 823 ntTSL 511.82□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.193e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 SLC25A28-203ENST00000479722 581 ntTSL 215.31■□□□□ 0.044e-13■■■■□ 26.2
SLTMQ9NWH9 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 26.1
SLTMQ9NWH9 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 26.1
SLTMQ9NWH9 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 26.1
SLTMQ9NWH9 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC13.19□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-11■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-11■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-11■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 215.59■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 MPRIP-201ENST00000313485 6050 ntTSL 518.51■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 MPRIP-219ENST00000584067 3195 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 MPRIP-215ENST00000579832 438 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 26
SLTMQ9NWH9 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 217.12■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 25.9
SLTMQ9NWH9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 25.9
SLTMQ9NWH9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 25.9
SLTMQ9NWH9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.952e-7■■■■□ 25.9
SLTMQ9NWH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.522e-7■■■■□ 25.9
SLTMQ9NWH9 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 518.94■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 25.9
SLTMQ9NWH9 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 523.52■■□□□ 1.362e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 37.16□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 37.16□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 CCDC57-208ENST00000475635 571 ntTSL 412.79□□□□□ -0.364e-9■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 GATD1-207ENST00000526650 457 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 GATD1-204ENST00000465313 446 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 RSRP1-209ENST00000562018 565 ntTSL 418.74■□□□□ 0.594e-10■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 RSRP1-215ENST00000567741 597 ntTSL 416.7■□□□□ 0.264e-10■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 RSRP1-218ENST00000568399 629 ntTSL 412.3□□□□□ -0.444e-10■■■■□ 25.8
SLTMQ9NWH9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 517.76■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 512.79□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 LINC01667-201ENST00000623554 1137 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.975e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.885e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.885e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 413.85□□□□□ -0.192e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 34.65□□□□□ -1.674e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.492e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.219e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 CTDP1-207ENST00000591598 3228 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.459e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.429e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 514.84□□□□□ -0.032e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-213ENST00000486164 781 ntTSL 314.4□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 321.48■■□□□ 1.035e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 419.53■□□□□ 0.725e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.665e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 417.46■□□□□ 0.395e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.625e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.175e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 26.4□□□□□ -1.385e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.015e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.769e-8■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 PRRC2B-206ENST00000456307 525 ntTSL 26.69□□□□□ -1.341e-7■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 25.7
SLTMQ9NWH9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 CTIF-209ENST00000591387 859 ntTSL 218.69■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 CTIF-210ENST00000591412 491 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 213.46□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 25.6
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