Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL11Q9NVR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL11Q9NVR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms