Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVAQ9NVD7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVAQ9NVD7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVAQ9NVD7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVAQ9NVD7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVAQ9NVD7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVAQ9NVD7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARVAQ9NVD7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVAQ9NVD7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVAQ9NVD7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms