Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMBRD1Q9NUN5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMBRD1Q9NUN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD1Q9NUN5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms