Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYDENQ9NUL5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RYDENQ9NUL5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYDENQ9NUL5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms