Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L1Q9NU39 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms