Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT84Q9NSB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT84Q9NSB2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT84Q9NSB2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms