Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL28Q9NRJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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