Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF3Q9NR23 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GDF3Q9NR23 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms