Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCFQ9NPI8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCFQ9NPI8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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