Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20AQ9NP66 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMG20AQ9NP66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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