Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC2Q9HCC0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms