Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM27Q9HBJ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms