Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP2Q9H5N1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABEP2Q9H5N1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms