Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOJQ9H4E5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOJQ9H4E5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOJQ9H4E5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms