Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC3BQ9H195 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC3BQ9H195 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms