Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRTNQ9H040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRTNQ9H040 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms