Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80BQ9C086 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80BQ9C086 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms