Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL3Q9BY60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms