Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR6

CFHR5, Complement factor H-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR5Q9BXR6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFHR5Q9BXR6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFHR5Q9BXR6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHR5Q9BXR6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFHR5Q9BXR6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFHR5Q9BXR6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms