Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGPP1Q9BX95 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGPP1Q9BX95 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGPP1Q9BX95 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms