Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNM1Q9BWG6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNM1Q9BWG6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNM1Q9BWG6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNM1Q9BWG6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms