Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP58Q9BVL2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP58Q9BVL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms