Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM175Q9BSA9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM175Q9BSA9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM175Q9BSA9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms