Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A3Q9BRY0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms