Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9BRP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9BRP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9BRP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9BRP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9BRP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9BRP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9BRP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9BRP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9BRP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9BRP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9BRP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9BRP9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9BRP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9BRP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9BRP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9BRP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9BRP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9BRP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9BRP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9BRP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9BRP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9BRP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9BRP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9BRP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9BRP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9BRP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms