Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX2Q9BQ50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms