Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF6BQ99941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATF6BQ99941 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF6BQ99941 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.4 ms