Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX2Q99697 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITX2Q99697 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms