Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POP1Q99575 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POP1Q99575 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POP1Q99575 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POP1Q99575 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POP1Q99575 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POP1Q99575 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POP1Q99575 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POP1Q99575 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POP1Q99575 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POP1Q99575 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POP1Q99575 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POP1Q99575 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POP1Q99575 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POP1Q99575 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POP1Q99575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POP1Q99575 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POP1Q99575 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POP1Q99575 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POP1Q99575 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POP1Q99575 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POP1Q99575 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POP1Q99575 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POP1Q99575 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POP1Q99575 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POP1Q99575 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POP1Q99575 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POP1Q99575 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POP1Q99575 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POP1Q99575 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POP1Q99575 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POP1Q99575 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POP1Q99575 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POP1Q99575 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POP1Q99575 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POP1Q99575 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POP1Q99575 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POP1Q99575 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POP1Q99575 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POP1Q99575 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POP1Q99575 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POP1Q99575 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POP1Q99575 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POP1Q99575 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POP1Q99575 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POP1Q99575 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POP1Q99575 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POP1Q99575 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POP1Q99575 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POP1Q99575 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POP1Q99575 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POP1Q99575 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POP1Q99575 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POP1Q99575 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POP1Q99575 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POP1Q99575 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POP1Q99575 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POP1Q99575 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POP1Q99575 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POP1Q99575 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POP1Q99575 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POP1Q99575 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POP1Q99575 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POP1Q99575 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POP1Q99575 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POP1Q99575 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POP1Q99575 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POP1Q99575 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POP1Q99575 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POP1Q99575 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POP1Q99575 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POP1Q99575 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POP1Q99575 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POP1Q99575 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms