Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP88Q99567 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP88Q99567 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP88Q99567 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP88Q99567 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms