Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGMNQ99538 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LGMNQ99538 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGMNQ99538 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms