Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNKPQ96T60 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNKPQ96T60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms