Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPG4P5Q96PW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms