Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXN4Q96NZ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXN4Q96NZ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXN4Q96NZ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms